Résumé
Entre le 1er mars 2020 et le 8 août 2021, environ 116,8 millions de tests antigéniques et RT-PCR ont été validés par un professionnel de santé, plus précisément, 29,1 millions de tests antigéniques et 87,7 millions de tests RT-PCR, dont 84,6 millions nasopharyngés, 2,9 millions de salivaires et 195 000 en milieux divers (graphique 1A).
Les délais de tests sont au plus bas. La part des tests (ensemble des RT-PCR et antigéniques) validés en moins de 24 heures est en légère augmentation, à 98 % cette semaine, contre 97 % la semaine précédente. La médiane et la moyenne des délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR sont stables, respectivement à 0,4 et 0,5 jour.
Le nombre de tests validés du 2 au 8 août est toujours en hausse pour les 26-40 ans, alors qu’il est relativement stable pour les autres tranches d’âge, et même en baisse pour les moins de 16 ans (graphique 1B).
La médiane et la moyenne des délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR sont stables, respectivement à 0,4 et 0,5 jour (graphique 2).
La part des tests RT-PCR validés en moins de 24 heures est en légère augmentation, à 95 %, contre 94 % la semaine précédente (graphique 3).
Plus de 9 départements sur 10 ont un délai médian entre prélèvement et validation du résultat d’un test RT-PCR inférieur à 12 heures (cartes 1 et 2).
Près de 6 tests sur 10 sont antigéniques.
Les départements où la part des tests antigéniques est la plus élevée sont l’Aube (10), les Hautes-Alpes (05) et Paris (75) [carte 3].
Sur l’ensemble des tests (RT-PCR et antigéniques) validés la semaine du 2 au 8 août 2021, la part des tests validés en moins de 24 heures s’élève à 98 % (graphique 5), contre 97 % la semaine précédente. Si l’on considère le délai en journées, et non plus en heures, ce sont 100 % des tests dont le résultat a été validé le jour ou le lendemain du prélèvement (graphique 6), contre 99 % la semaine précédente.
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Méthodologie
La DREES exploite les données pseudonymisées du système d’information SI-DEP, qui portent notamment sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés par les laboratoires d’analyse médicale, et comportent des informations à la fois sur les résultats des tests et sur leurs délais de réalisation. Le calcul des délais pour les tests RT-PCR se fait à partir de la date de prélèvement du test (jour, heure, minute), déclarée par le laboratoire, et de la date d’intégration (jour, heure, minute) du test dans le système d’information, intégration qui doit se faire très rapidement après la validation du test. Les délais ici présentés pour les tests RT-PCR correspondent aux délais entre la date de prélèvement et la date d’intégration des résultats dans SI-DEP. Cependant, la date d’envoi des résultats aux patients par le laboratoire peut être postérieure à l’intégration des résultats dans SIDEP. Les délais entre date de prélèvement et réception des résultats des tests RT-PCR par les patients pourraient donc être supérieurs à ceux mesurés via SIDEP. Les statistiques présentées portent sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés, en date de validation du résultat.
Depuis le 17 octobre, les tests antigéniques sont autorisés dans le cadre des dépistages individuels. Ils doivent être remontés depuis lors dans la base SIDEP par les laboratoires. En revanche, la saisie d’information dans SIDEP pour les professionnels de santé n’est possible que depuis le 16 novembre, et a connu une phase de montée en charge. Afin d’estimer le nombre total de tests antigéniques réalisés depuis le 17 octobre, la DREES utilise les données de l’Assurance maladie sur le nombre de tests remboursés en date de soins en complément des données renseignées dans SIDEP. Les tests antigéniques sont des tests pour lesquels le résultat est connu très rapidement, avec un délai entre prélèvement et validation du résultat généralement inférieur à 30 minutes.
Par ailleurs, si une même personne a réalisé successivement deux tests, ces deux tests sont donc comptés. Les données sur le nombre de tests diffèrent de celles publiées par Santé publique France, en date de prélèvement du test.
Enfin, entre début mars et début juin 2020, préalablement au déploiement complet de SIDEP, la DREES a mis en place à la demande du centre de crise sanitaire un système d’information permettant de comptabiliser le nombre de tests RT-PCR réalisés en France, à partir des déclarations des sites réalisant les tests (et non les prélèvements comme dans SIDEP).
Dans le cadre de l'exploitation des données SIDEP, la DREES procède à quelques retraitements des données. En particulier, les tests remontés avec un pseudonyme manquant sont supprimés. Dans le cas d'un même test remonté plusieurs fois (mise à jour de certaines informations sur le patient par exemple), la DREES conserve la ligne la plus récente, à l'exception de la date d'intégration dans SIDEP dont on retient la valeur la plus ancienne, assimilée à la date de validation du résultat.