Résumé Entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021, 3 466 500 tests RT-PCR et antigéniques pour la détection du SARS-Cov2 ont été validés (dont 65,5 % de tests antigéniques), contre 3 594 700 tests (dont 66,1 % de tests antigéniques) la semaine précédente, soit une diminution de 128 200 tests. Entre le 1er mars 2020 et le 3 octobre 2021, environ 153 162 000 tests antigéniques et RT-PCR ont été validés par un professionnel de santé, plus précisément, 54,2 millions de tests antigéniques et 99,0 millions de tests RT-PCR dont 95,0 millions naso-pharyngés, 3,8 millions salivaires et 228 000 en milieux divers (Graphique 1A). La part des tests (ensemble des tests RT-PCR et antigéniques) validés en moins de 24 heures reste stable par rapport à la semaine précédente, à 99 %. La médiane et la moyenne des délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR sont stables, respectivement à 0,3 et 0,4 jour. Graphique 1A • Nombre de tests RT-PCR et antigéniques réalisés par jour et semaine glissante Lecture : Le 3 octobre 2021, 109 274 résultats de tests ont été validés, dont 70 322 tests antigéniques. Du 27 septembre au 3 octobre 2021, 3 466 495 résultats de tests ont été validés, dont 2 269 013 tests antigéniques. Champ : Tests RT-PCR remontés via l’enquête DREES auprès des laboratoires entre le 1er mars 2020 et le 7 juin 2020 ; et tests RT-PCR et antigéniques avec dates de validation depuis le 7 juin 2020, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 5 octobre 2021 5h. Du fait de la montée en charge progressive de la saisie des tests antigéniques, le nombre de tests antigéniques dans SI-DEP est sous-estimé jusqu’à fin novembre. Avant cette date, les résultats positifs associés étaient intégrés directement dans Contact-Covid afin de permettre le dispositif de contact tracing. Source : SI-DEP - Enquête DREES Laboratoires ; calculs DREES Le nombre de tests validés du 27 septembre au 3 octobre 2021 est en nette baisse pour les 16-65 ans. Il diminue plus légèrement chez les plus de 65 ans, et connaît au contraire une hausse chez les moins de 15 ans avec plus de 85 000 tests supplémentaires par rapport à la semaine dernière (Graphique 1B). Graphique 1B • Nombre de tests (RT-PCR et antigéniques) sur 7 jours glissants par tranche d’âge Lecture : Entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021, 604 177 tests validés concernaient les 16-25 ans. Champ : Tests RT-PCR et antigéniques avec dates de validation depuis le 7 juin 2020 et âge renseigné, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 5 octobre 2021 5h. Source : SI-DEP ; calculs DREES La proportion de tests antigéniques réalisés est plus élevée parmi les tranches d’âges intermédiaires (16-65 ans), et a fortement augmenté pour toutes les tranches d’âge depuis début juillet jusqu’à fin août, avant de connaître une stabilisation, à l’exception des moins de 16 ans. Dans cette tranche d’âge spécifique, cette proportion a diminué nettement depuis fin août jusqu’à la semaine du 27 septembre où elle augmente de nouveau fortement (graphique 1C). La ventilation par tranche d’âge souligne que la part des tests antigéniques dans l’ensemble des tests est la plus élevée pour les 16-25 ans (81,0 %) et la plus faible pour les plus de 75 ans (24,4 %) (Tableau 1). Graphique 1C • Proportion de tests antigéniques réalisés parmi le total des tests RT-PCR et antigéniques (en %) par tranche d’âge, en date de validation sur une semaine glissante Lecture : 81,0 % des tests réalisés par les 16-25 ans validés entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021 sont des tests antigéniques. Champ : tests RT-PCR et antigéniques avec dates de validation jusqu’au 3 octobre 2021 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 5 octobre 2021 5h. Suppression des lignes avec pseudonymes manquants et des tests en doublon. Source : SI-DEP ; calculs DREES. Tableau 1 • Proportion de tests antigéniques réalisés parmi le total des tests RT-PCR et antigéniques (en %) par tranche d’âge, pour les tests validés du 27 septembre au 3 octobre 2021 et du 20 au 26 septembre 2021 Lecture : 81,0 % des tests réalisés par les 16-25 ans validés entre le 27 septembre et le 3 octobre sont des tests antigéniques. Champ : tests RT-PCR et antigéniques avec dates de validation du 20 septembre au 3 octobre 2021 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 5 octobre 2021 5h. Suppression des lignes avec pseudonymes manquants et des tests en doublon. Source : SI-DEP ; calculs DREES. On observe une hausse du nombre de tests salivaires depuis le début du mois de septembre, concentrée sur les plus jeunes âges, en lien avec la rentrée scolaire (Graphique 1D). Graphique 1D • Nombre de tests salivaires sur 7 jours glissants par tranche d’âge Lecture : Entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021, 155 919 tests RT-PCR salivaires concernaient les 0-11 ans. Champ : Tests RT-PCR salivaires avec dates de validation depuis le 1er février 2021 et âge renseigné, remontés dans les envois quotidiens SIDEP reçus par la DREES jusqu’au 5 octobre 2021 5h. Suppression des lignes avec pseudonymes manquants et des tests en doublon. Source : SIDEP ; calculs DREES La médiane et la moyenne des délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR sont stables, respectivement à 0,3 et 0,4 jour (Graphique 2). Graphique 2 • Évolution des délais entre prélèvement et validation du résultat pour les tests RT-PCR en France Lecture : Entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021, la moitié des tests RT-PCR ont été validés en 0,3 jour ou moins. Sur la même période, la moyenne du délai était de 0,4 jour. Champ : Tests RT-PCR avec dates de validation depuis le 25 juin 2020, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 5 octobre 2021 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants. Source : SI-DEP ; calculs DREES La part des tests RT-PCR validés en moins de 24 h est stable à 96 % (Graphiques 3 et 4). Graphique 3 • Distribution des délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR Lecture : 99,8 % des tests RT-PCR validés entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021 ont été prélevés dans les 72h précédentes. Champ : Tests RT-PCR remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 5 octobre 2021 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants. Source : SI-DEP ; calculs DREES Graphique 4 • Répartition des délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021 Lecture : 96,0 % des tests RT-PCR validés entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021 ont été prélevés dans les 24h précédentes. Champ : Tests RT-PCR avec dates de validation entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 5 octobre 2021 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants. Source : SI-DEP ; calculs DREES 98 départements sur 101 ont un délai médian entre prélèvement et validation du résultat d’un test RT-PCR inférieur à 12 h (Cartes 1 et 2). Carte 1 • Délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR par département entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021 Lecture : Entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021, le délai médian pour les résidents de l’Ain (01) est compris entre 0 et 0,5 jour, c’est-à-dire que plus de la moitié des tests ont un délai entre prélèvement et validation du résultat inférieur à 0,5 jour. Champ : Tests RT-PCR avec dates de validation entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 5 octobre 2021 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants. Le département est le département de résidence du patient. Source : SI-DEP ; calculs DREES Carte 2 • Délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR en Île-de-France entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021 Lecture : Entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021, le délai médian pour les résidents des Yvelines (78) est compris entre 0 et 0,5 jour, c’est-à-dire que plus de la moitié des tests ont un délai entre prélèvement et validation du résultat inférieur à 0,5 jour. Champ : Tests RT-PCR avec dates de validation entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 5 octobre 2021 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants. Le département est le département de résidence du patient. Source : SI-DEP ; calculs DREES Environ 65% des tests réalisés sont antigéniques. Les départements où la part des tests antigéniques est la plus élevée sont la Guadeloupe (971) (84,6 %), les Hautes-Alpes (05) et Mayotte (976) (Carte 3). Carte 3 • Proportion de tests antigéniques par département entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021 (en %) Lecture : Entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021, la part des tests antigéniques validés dans le Finistère (29) se situait entre 40 et 60 %. Champ : Tests RT-PCR et antigéniques avec dates de validation entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 5 octobre 2021 5h. Le département est le département de résidence du patient. Source : SI-DEP ; calculs DREES Sur l’ensemble des tests (RT-PCR et antigéniques) validés la semaine du 27 septembre au 3 octobre 2021, la part des tests validés en moins de 24 heures s’élève à 99 %, comme la semaine précédente (Graphique 5). Si l’on considère le délai en journées, et non plus en heures, ce sont 100 % des tests dont le résultat a été validé le jour ou le lendemain du prélèvement, comme la semaine précédente (Graphique 6). Graphique 5 • Part des résultats validés en moins de 24 heures pour les tests RT-PCR et antigéniques Lecture : 95,9 % des tests RT-PCR validés entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021 ont été prélevés dans les 24 heures précédentes. 98,6 % des tests RT-PCR et antigéniques validés entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021 ont été prélevés dans les 24 heures précédentes. Champ : Tests RT-PCR et antigéniques remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 5 octobre 2021 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants. Source : SI-DEP ; calculs DREES Graphique 6 • Part des résultats validés le jour ou le lendemain du prélèvement pour les tests RT-PCR et antigéniques Lecture : 99,1 % des tests RT-PCR validés entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021 ont été prélevés le jour-même ou la veille. 99,7 % des tests RT-PCR et antigéniques validés entre le 27 septembre et le 3 octobre 2021 ont été prélevés le jour-même ou la veille. Champ : Tests RT-PCR et antigéniques remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 5 octobre 2021 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants. Source : SI-DEP ; calculs DREES Consulter la datavisualisation Méthodologie La DREES exploite les données pseudonymisées du système d’information SI-DEP, qui portent notamment sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés par les laboratoires d’analyse médicale, et comportent des informations à la fois sur les résultats des tests et sur leurs délais de réalisation. Le calcul des délais pour les tests RT-PCR se fait à partir de la date de prélèvement du test (jour, heure, minute), déclarée par le laboratoire, et de la date d’intégration (jour, heure, minute) du test dans le système d’information, intégration qui doit se faire très rapidement après la validation du test. Les délais ici présentés pour les tests RT-PCR correspondent aux délais entre la date de prélèvement et la date d’intégration des résultats dans SI-DEP. Cependant, la date d’envoi des résultats aux patients par le laboratoire peut être postérieure à l’intégration des résultats dans SIDEP. Les délais entre date de prélèvement et réception des résultats des tests RT-PCR par les patients pourraient donc être supérieurs à ceux mesurés via SIDEP. Les statistiques présentées portent sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés, en date de validation du résultat. Depuis le 17 octobre, les tests antigéniques sont autorisés dans le cadre des dépistages individuels. Ils doivent être remontés depuis lors dans la base SIDEP par les laboratoires. En revanche, la saisie d’information dans SIDEP pour les professionnels de santé n’est possible que depuis le 16 novembre, et a connu une phase de montée en charge. Afin d’estimer le nombre total de tests antigéniques réalisés depuis le 17 octobre, la DREES utilise les données de l’Assurance maladie sur le nombre de tests remboursés en date de soins en complément des données renseignées dans SIDEP. Les tests antigéniques sont des tests pour lesquels le résultat est connu très rapidement, avec un délai entre prélèvement et validation du résultat généralement inférieur à 30 minutes. Par ailleurs, si une même personne a réalisé successivement deux tests, ces deux tests sont donc comptés. Les données sur le nombre de tests diffèrent de celles publiées par Santé publique France, en date de prélèvement du test. Enfin, entre début mars et début juin 2020, préalablement au déploiement complet de SIDEP, la DREES a mis en place à la demande du centre de crise sanitaire un système d’information permettant de comptabiliser le nombre de tests RT-PCR réalisés en France, à partir des déclarations des sites réalisant les tests (et non les prélèvements comme dans SIDEP). Dans le cadre de l’exploitation des données SIDEP, la DREES procède à quelques retraitements des données. En particulier, les tests remontés avec un pseudonyme manquant sont supprimés. Dans le cas d’un même test remonté plusieurs fois (mise à jour de certaines informations sur le patient par exemple), la DREES conserve la ligne la plus récente, à l’exception de la date d’intégration dans SIDEP dont on retient la valeur la plus ancienne, assimilée à la date de validation du résultat.
