Résumé
Entre le 1er mars 2020 et le 28 novembre 2021, environ 174 551 000 tests antigéniques et RT-PCR ont été validés par un professionnel de santé, plus précisément, 66 246 000 tests antigéniques et 108 304 000 tests RT-PCR dont 102 867 000 naso-pharyngés, 5 182 000 salivaires et 255 000 en milieux divers (Graphique 1A).
La part des tests (ensemble des tests RT-PCR et antigéniques) validés en moins de 24 heures est stable à 97%, alors que cette même part baisse légèrement au cours de la semaine si l’on ne considère que les tests RT-PCR, passant de 95 % en début de semaine à 93% en fin de semaine (Graphique 5). La médiane et la moyenne des délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR sont stables par rapport à la semaine précédente, respectivement à 0,4 et 0,5 jour.
On observe durant les 7 derniers jours plus de 500 tests positifs pour 100 000 habitants parmi les moins de 15 ans, soit 43 % de plus que le maximum précédent (350) observé en avril 2021 lors de la troisième vague (graphique A).
Les nombres de tests positifs pour 100 000 habitants pour les autres tranches d’âges sont en revanche actuellement davantage comparables à ce qu’ils étaient lors des vagues précédentes.
Les moins de 15 ans représentent 23 % de l’ensemble des tests positifs, proportion qui augmente nettement depuis le début de cette 5e vague. Cette proportion a pu déjà atteindre par le passé des niveaux presque aussi élevés : plus de 20 % début octobre 2021 (et plus de 15 % fin mai 2021, graphique B). Cependant, ces pics passés s’observaient durant des périodes d’incidence faible donc en « creux de vague ». Cette hausse de la part du nombre de cas positifs pour 100 000 habitants attribuable aux moins de 15 ans dans un contexte de flambée épidémique semble donc spécifique à la 5e vague.
On observe simultanément une très forte augmentation du nombre de tests chez les plus jeunes, ce qui explique au moins pour partie la hausse du nombre de tests positifs chez les moins de 15 ans (graphique 1B, hors encadré).
Graphique 1A • Nombre de tests RT-PCR et antigéniques réalisés par jour et semaine glissante
Lecture : Le 28 novembre 2021, 138 545 résultats de tests ont été validés, dont 69 982 tests antigéniques. Du 22 novembre au 28 novembre 2021, 4 022 367 résultats de tests ont été validés, dont 2 104 253 tests antigéniques.
Champ : Tests RT-PCR remontés via l’enquête DREES auprès des laboratoires entre le 1er mars 2020 et le 7 juin 2020 ; et tests RT-PCR et antigéniques avec dates de validation depuis le 7 juin 2020, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 30 novembre 2021 5h. Du fait de la montée en charge progressive de la saisie des tests antigéniques, le nombre de tests antigéniques dans SI-DEP est sous-estimé jusqu’à fin novembre. Avant cette date, les résultats positifs associés étaient intégrés directement dans Contact-Covid afin de permettre le dispositif de contact tracing.
Source : SI-DEP - Enquête DREES Laboratoires ; calculs DREES
Le nombre de tests validés du 22 novembre au 28 novembre 2021 est en hausse pour l’ensemble des tranches d’âge (Graphique 1B). L’évolution du nombre de tests chez les moins de 15 ans est la suivante : 439 947 tests ; 16-25 ans ; 107 706 tests, 26-40 ans ; 222 955 tests ; 41-65 ans : 273 171 tests ; 66-75 ans : 44 748 tests ; plus de 75 ans : 28 431 tests.
Graphique 1B • Nombre de tests (RT-PCR et antigéniques) sur 7 jours glissants par tranche d’âge
Lecture : Entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021, 451 940 tests validés concernaient les 16-25 ans.
Champ : Tests RT-PCR et antigéniques avec dates de validation depuis le 7 juin 2020 et âge renseigné, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 30 novembre 2021 5h.
Source : SI-DEP ; calculs DREES
La proportion de tests antigéniques réalisée est plus élevée parmi les tranches d’âges intermédiaires (16-65 ans), et a fortement augmenté pour toutes de début juillet jusqu’à fin août. Chez les moins de 16 ans, elle a été fortement affectée par les vacances de la Toussaint, contexte de réduction des tests RT-PCR salivaires en milieu scolaire (graphique 1C). Sur la semaine du 22 au 28 novembre, elle reste stable ou augmente légèrement pour toutes les tranches d’âge. La part des tests antigéniques dans l’ensemble des tests est la plus élevée pour les 16-25 ans (67,5 %) et la plus faible pour les plus de 75 ans (21,9 %) (Tableau 1).
Graphique 1C • Proportion de tests antigéniques réalisés parmi le total des tests RT-PCR et antigéniques (en %) par tranche d’âge, en date de validation sur une semaine glissante
Lecture : 67,5 % des tests réalisés par les 16-25 ans validés entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021 sont des tests antigéniques.
Champ : tests RT-PCR et antigéniques avec dates de validation jusqu’au 28 novembre 2021 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 30 novembre 2021 5h. Suppression des lignes avec pseudonymes manquants et des tests en doublon.
Source : SI-DEP ; calculs DREES.
Tableau 1 • Proportion de tests antigéniques réalisés parmi le total des tests RT-PCR et antigéniques (en %) par tranche d’âge, pour les tests validés du 22 novembre au 28 novembre 2021 et du 15 novembre au 21 novembre 2021
Lecture : 67,5 % des tests réalisés par les 16-25 ans validés entre le 22 novembre et le 28 novembre sont des tests antigéniques.
Champ : tests RT-PCR et antigéniques avec dates de validation du 15 novembre au 28 novembre 2021 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 30 novembre 2021 5h. Suppression des lignes avec pseudonymes manquants et des tests en doublon.
Source : SI-DEP ; calculs DREES.
On observe une très forte hausse du nombre de tests salivaires depuis la fin des vacances de la Toussaint, concentrée sur les plus jeunes âges, en lien avec la rentrée scolaire (Graphique 1D). Le nombre de tests salivaires réalisés du 22 au 28 novembre approche le seuil des 350 000 tests, soit le plus haut niveau jamais atteint.
Graphique 1D • Nombre de tests salivaires sur 7 jours glissants par tranche d’âge
Lecture : Entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021, tests RT-PCR salivaires concernaient les 0-11 ans.
Champ : Tests RT-PCR salivaires avec dates de validation depuis le 1er février 2021 et âge renseigné, remontés dans les envois quotidiens SIDEP reçus par la DREES jusqu’au 30 novembre 2021 5h. Suppression des lignes avec pseudonymes manquants et des tests en doublon.
Source : SIDEP ; calculs DREES
La médiane et la moyenne des délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR sont stables, respectivement à 0,4 et 0,5 jour, mais on observe une légère tendance à la hausse depuis la mi-novembre (Graphique 2).
Graphique 2 • Évolution des délais entre prélèvement et validation du résultat pour les tests RT-PCR en France
Lecture : Entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021, la moitié des tests RT-PCR ont été validés en 0,4 jour ou moins. Sur la même période, la moyenne du délai était de 0,5 jour.
Champ : Tests RT-PCR avec dates de validation depuis le 25 juin 2020, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 30 novembre 2021 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants.
Source : SI-DEP ; calculs DREES
La part des tests RT-PCR validés en moins de 24 h chute légèrement et atteint 93 % (contre 95 % la semaine précédente) (Graphiques 3 et 4).
Graphique 3 • Distribution des délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR
Lecture : 99,8 % des tests RT-PCR validés entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021 ont été prélevés dans les 72h précédentes.
Champ : Tests RT-PCR remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 30 novembre 2021 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants.
Source : SI-DEP ; calculs DREES
Graphique 4 • Répartition des délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021
Lecture : 93,0 % des tests RT-PCR validés entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021 ont été prélevés dans les 24h précédentes.
Champ : Tests RT-PCR avec dates de validation entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 30 novembre 2021 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants.
Source : SI-DEP ; calculs DREES
9 départements sur 10 ont un délai médian entre prélèvement et validation du résultat d’un test RT-PCR inférieur à 12 h (Cartes 1 et 2).
Carte 1 • Délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR par département entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021
Lecture : Entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021, le délai médian pour les résidents de l’Ain (01) est compris entre 0 et 0,5 jour, c’est-à-dire que plus de la moitié des tests ont un délai entre prélèvement et validation du résultat inférieur à 0,5 jour.
Champ : Tests RT-PCR avec dates de validation entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 30 novembre 2021 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants. Le département est le département de résidence du patient.
Source : SI-DEP ; calculs DREES
Carte 2 • Délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR en Île-de-France entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021
Lecture : Entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021, le délai médian pour les résidents des Yvelines (78) est compris entre 0,5 et 1 jour, c’est-à-dire que plus de la moitié des tests ont un délai entre prélèvement et validation du résultat inférieur à 1 jour.
Champ : Tests RT-PCR avec dates de validation entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 30 novembre 2021 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants. Le département est le département de résidence du patient.
Source : SI-DEP ; calculs DREES
52,3 % des tests réalisés sont antigéniques.
Les départements où la part des tests antigéniques est la plus élevée sont la Guadeloupe (77,5 %), la Martinique (77,3 %) et les Hautes-Alpes (68,7 %) (Carte 3).
Carte 3 • Proportion de tests antigéniques par département entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021 (en %)
Lecture : Entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021, la part des tests antigéniques validés dans le Finistère (29) se situait entre 40 et 60 %.
Champ : Tests RT-PCR et antigéniques avec dates de validation entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021 inclus, remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 30 novembre 2021 5h. Le département est le département de résidence du patient.
Source : SI-DEP ; calculs DREES
Sur l’ensemble des tests (RT-PCR et antigéniques) validés la semaine du 22 novembre au 28 novembre 2021, la part des tests validés en moins de 24 heures s’élève à 97 %, comme la semaine précédente (Graphique 5). Si l’on considère le délai en journées, et non plus en heures, ce sont 99 % des tests dont le résultat a été validé le jour ou le lendemain du prélèvement, également comme la semaine précédente (Graphique 6).
Graphique 5 • Part des résultats validés en moins de 24 heures pour les tests RT-PCR et antigéniques
Lecture : 93,0 % des tests RT-PCR validés entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021 ont été prélevés dans les 24 heures précédentes. 96,6 % des tests RT-PCR et antigéniques validés entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021 ont été prélevés dans les 24 heures précédentes.
Champ : Tests RT-PCR et antigéniques remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 30 novembre 2021 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants.
Source : SI-DEP ; calculs DREES
Graphique 6 • Part des résultats validés le jour ou le lendemain du prélèvement pour les tests RT-PCR et antigéniques
Lecture : 98,8 % des tests RT-PCR validés entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021 ont été prélevés le jour-même ou la veille. 99,4 % des tests RT-PCR et antigéniques validés entre le 22 novembre et le 28 novembre 2021 ont été prélevés le jour-même ou la veille.
Champ : Tests RT-PCR et antigéniques remontés dans les envois quotidiens SI-DEP reçus par la DREES jusqu’au 30 novembre 2021 5h. Exclusion des tests avec délais aberrants.
Source : SI-DEP ; calculs DREES
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Méthodologie
La DREES exploite les données pseudonymisées du système d’information SI-DEP, qui portent notamment sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés par les laboratoires d’analyse médicale, et comportent des informations à la fois sur les résultats des tests et sur leurs délais de réalisation. Le calcul des délais pour les tests RT-PCR se fait à partir de la date de prélèvement du test (jour, heure, minute), déclarée par le laboratoire, et de la date d’intégration (jour, heure, minute) du test dans le système d’information, intégration qui doit se faire très rapidement après la validation du test. Les délais ici présentés pour les tests RT-PCR correspondent aux délais entre la date de prélèvement et la date d’intégration des résultats dans SI-DEP. Cependant, la date d’envoi des résultats aux patients par le laboratoire peut être postérieure à l’intégration des résultats dans SIDEP. Les délais entre date de prélèvement et réception des résultats des tests RT-PCR par les patients pourraient donc être supérieurs à ceux mesurés via SIDEP. Les statistiques présentées portent sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés, en date de validation du résultat.
Depuis le 17 octobre 2020, les tests antigéniques sont autorisés dans le cadre des dépistages individuels. Ils doivent être remontés depuis lors dans la base SIDEP par les laboratoires. En revanche, la saisie d’information dans SIDEP pour les professionnels de santé n’est possible que depuis le 16 novembre 2020, et a connu une phase de montée en charge. Afin d’estimer le nombre total de tests antigéniques réalisés depuis le 17 octobre 2020, la DREES utilise les données de l’Assurance maladie sur le nombre de tests remboursés en date de soins en complément des données renseignées dans SIDEP. Les tests antigéniques sont des tests pour lesquels le résultat est connu très rapidement, avec un délai entre prélèvement et validation du résultat généralement inférieur à 30 minutes.
Par ailleurs, si une même personne a réalisé successivement deux tests, ces deux tests sont donc comptés. Les données sur le nombre de tests diffèrent de celles publiées par Santé publique France, en date de prélèvement du test.
Enfin, entre début mars et début juin 2020, préalablement au déploiement complet de SIDEP, la DREES a mis en place à la demande du centre de crise sanitaire un système d’information permettant de comptabiliser le nombre de tests RT-PCR réalisés en France, à partir des déclarations des sites réalisant les tests (et non les prélèvements comme dans SIDEP).
Dans le cadre de l’exploitation des données SIDEP, la DREES procède à quelques retraitements des données. En particulier, les tests remontés avec un pseudonyme manquant sont supprimés. Dans le cas d’un même test remonté plusieurs fois (mise à jour de certaines informations sur le patient par exemple), la DREES conserve la ligne la plus récente, à l’exception de la date d’intégration dans SIDEP dont on retient la valeur la plus ancienne, assimilée à la date de validation du résultat.