Depuis octobre 2020, la Direction de la recherche, des études, de l’évaluation et des statistiques (DREES) met régulièrement à disposition les données sur le volume et les délais de validation des tests RT-PCR et antigéniques. Ces résultats sont issus des données du système d’information SI-DEP. Recul du nombre de tests RT-PCR naso-pharyngés, RT-PCR salivaires et antigéniques réalisés cette semaine Entre le 19 et le 25 décembre 2022, 1 561 100 tests RT-PCR et antigéniques pour la détection du SARS-Cov2 ont été validés (dont 61,9 % de tests antigéniques), contre 1 744 700 tests (dont 59,4 % de tests antigéniques) la semaine précédente (-11 %). Le nombre de tests est en baisse pour l’ensemble des tranches d’âge (graphiques 1A et 1B). Par rapport à la semaine précédente, les variations de volumes sont de : -71 800 tests pour les moins de 16 ans (-34 %), -16 800 tests pour les 16-25 ans (-8 %), -14 200 tests pour les 26-40 ans (-4 %), -49 600 tests pour les 41-65 ans (-9 %), -16 300 tests pour les 66-75 ans (-8 %), -14 900 tests pour les plus de 75 ans (-7 %). Cette semaine, le nombre de tests RT-PCR salivaires est également en baisse (-25 %), 72,2 % d’entre eux ont été réalisés sur des enfants âgés de 11 ans ou moins (graphique 1C). Graphique 1A • Nombre de tests RT-PCR et antigéniques réalisés par semaine glissante Graphique 1B • Nombre de tests (RT-PCR et antigéniques) sur 7 jours glissants par tranche d’âge Graphique 1C • Nombre de tests salivaires sur 7 jours glissants par tranche d’âge Fortes variations de la proportion de tests antigéniques dans l’ensemble des tests selon l’âge et le département Au cours de la semaine du 19 au 25 décembre 2022, les tests antigéniques représentent 61,9 % de l’ensemble des tests, mais cette proportion varie fortement selon l’âge : elle atteint ainsi 72,4 % chez les 16 à 25 ans, contre 40,1 % chez les plus de 75 ans (graphique 2). On note également de fortes disparités territoriales (carte 1) : au cours de la semaine dernière, les départements pour lesquels la part de tests antigéniques est la plus importante sont la Guadeloupe (84,3 %) et la Martinique (80,6 %). Graphique 2 • Proportion de tests antigéniques réalisés parmi le total des tests RT-PCR et antigéniques (en %) par tranche d’âge, en date de validation sur une semaine glissante Carte 1 • Proportion de tests antigéniques par département (en %) Des délais de validation stables Sur l’ensemble des tests (RT-PCR et antigéniques) validés la semaine du 19 au 25 décembre 2022, la part des tests validés le jour ou le lendemain du prélèvement s’élève à 99 %, comme la semaine précédente (graphique 3). Pour les tests RT-PCR seuls, la durée médiane entre prélèvement et validation du résultat est stable à 0,3 jour (graphique 4). La part des tests RT-PCR validés en moins de 24 h est également stable à 94 % (graphique 5). La quasi-totalité des départements ont un délai médian entre prélèvement et validation du résultat d’un test RT-PCR inférieur à 12 h (carte 2). Graphique 3 • Part des résultats validés le jour ou le lendemain du prélèvement pour les tests RT-PCR et antigéniques Graphique 4 • Évolution des délais entre prélèvement et validation du résultat pour les tests RT-PCR Graphique 5 • Distribution des délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR Carte 2 • Délais entre prélèvement et validation du résultat des tests RT-PCR par département Consulter la datavisualisation Méthodologie La DREES exploite les données pseudonymisées du système d’information SI-DEP, qui portent notamment sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés par les laboratoires d’analyse médicale, et comportent des informations à la fois sur les résultats des tests et sur leurs délais de réalisation. Le calcul des délais pour les tests RT-PCR se fait à partir de la date de prélèvement du test (jour, heure, minute), déclarée par le laboratoire, et de la date d’intégration (jour, heure, minute) du test dans le système d’information, intégration qui doit se faire très rapidement après la validation du test. Les délais ici présentés pour les tests RT-PCR correspondent aux délais entre la date de prélèvement et la date d’intégration des résultats dans SI-DEP. Cependant, la date d’envoi des résultats aux patients par le laboratoire peut être postérieure à l’intégration des résultats dans SIDEP. Les délais entre date de prélèvement et réception des résultats des tests RT-PCR par les patients pourraient donc être supérieurs à ceux mesurés via SIDEP. Les statistiques présentées portent sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés, en date de validation du résultat. Depuis le 17 octobre 2020, les tests antigéniques sont autorisés dans le cadre des dépistages individuels. Ils doivent être remontés depuis lors dans la base SIDEP par les laboratoires. En revanche, la saisie d’information dans SIDEP pour les professionnels de santé n’est possible que depuis le 16 novembre 2020, et a connu une phase de montée en charge. Afin d’estimer le nombre total de tests antigéniques réalisés depuis entre le 17 octobre 2020 et fin novembre 2020 – période pendant laquelle la base SIDEP n’était pas exhaustive sur ce type de tests, la DREES a utilisé les données de l’Assurance maladie sur le nombre de tests remboursés en date de soins en complément des données renseignées dans SIDEP. Par ailleurs, si une même personne a réalisé successivement deux tests, ces deux tests sont comptés. Les données sur le nombre de tests diffèrent de celles publiées par Santé publique France, en date de prélèvement du test. Enfin, entre début mars et début juin 2020, préalablement au déploiement complet de SIDEP, la DREES a mis en place à la demande du centre de crise sanitaire du Ministère de la Santé un système d’information permettant de comptabiliser le nombre de tests RT-PCR réalisés en France, à partir des déclarations des sites réalisant les tests (et non les prélèvements comme dans SIDEP). Dans le cadre de l’exploitation des données SIDEP, la DREES procède à quelques retraitements des données. En particulier, les tests remontés avec un pseudonyme manquant sont supprimés. Dans le cas d’un même test remonté plusieurs fois (mise à jour de certaines informations sur le patient par exemple), la DREES conserve la ligne la plus récente, à l’exception de la date d’intégration dans SIDEP dont on retient la valeur la plus ancienne, assimilée à la date de validation du résultat.
